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软件特色
1、DNA和蛋白质序列编辑。
2、DNA序列转化。
3、多序列比对,对齐编辑和分析。
4、系统树分析。
5、DNA或蛋白质序列的点阵比较。
6、DNA序列组装和编辑。
7、BLAST通过网络界面在Intranet / Internet Server上进行搜索。
8、序列和数据库中的增强型图案搜索。
9、SiRNA选择器。
10、限制分析。
11、绘制序列图与出版品质。
12、限制模式预测。
13、电子克隆。
14、从限制片段重建限制图。
15、静音突变分析创建/破坏限制性位点。
16、导向不匹配以创建/破坏限制站点。
17、翻译和密码子使用分析。
18、蛋白质疏水性/亲水性分析。
19、蛋白质表征:等电点的序列组成和预测。
20、蛋白质二级结构预测。
21、反向翻译。
22、PCR和测序引物的设计。
23、表征DNA或引物序列的热力学性质。
24、分歧分析。
25、管理寡核苷酸,DNA和蛋白质数据库。
26、生成随机序列。
软件地址: https://ttccrj.top/8632.html?id=J088hVW3K4NZR5w5mvb2Gc
DNAMAN设计引物
1、先要拿到自己要设计引物的目的基因。
2、打开DNAMAN软件,打开软件后点击软件菜单栏的Primer选项,在弹出的选择中选择Load Primer,在二甲菜单中选择From Input选项。
3、导入文件后,点击菜单栏的Primer选项,在弹出的选项中选择Melting Temperature。
4、打开Melting Temperature对话框,您可以修改Thermo这个选项,Thermo值一般在55℃到70℃之间比较好。
5、从上图可以看到我们这20个碱基的Tm值只有49度,显然太低,需要增加碱基数量。我们取前24个碱基粘贴进去,点击下方Show Tm便可以看到这个引物的Tm值,发现是60.3度,很合适,就用这个了。这样正向引物就设计完了,把这24个碱基序列保存下来。
使用方法
1、打开软件点击软件顶部的点击File,在弹出的选择中选择new。
2、在新建好的对话框中输入DNA序列。
3、输入完后,同时按住键盘上Ctrl和A,选中序列,并单击软件顶部“seq”图中以为大家标注出来。
4、然后点击软件顶部的Sequence选项,在弹出的选项中点击Display,在二级菜单中点击Rev.Compl.Sequence。
5、然后就可以得到原序列的反向互补序列。
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